Modele anatomiczne czaszki odgrywają ważną pracę w edukacji medycznej, badaniach naukowych również w praktyce medycznej. Ich znaczenie wynika z konieczności dokładnego poznania budowy czaszki, jaka jest jednym spośród wysoce skomplikowanych elementów naszego szkieletu. Modele anatomiczne pozwalają one na określone przestudiowanie układu kostnego, wzajemnych zależności pomiędzy poszczególnymi elementami czaszki również na pozytywniejsze poznanie mechanizmów urazów, deformacji i patologii. Modele anatomiczne czaszki są też szeroko wykorzystywane w stomatologii. Budowa czaszki ma niebagatelne znaczenie w diagnostyce oraz pomaganiu schorzeń jamy ustnej, wad zgryzu czy problemów ortodontycznych. W ortodoncji modele anatomiczne czaszki pomagają w ocenie struktury żuchwy i szczęki, co umożliwia precyzyjne zaplanowanie leczenia aparatami ortodontycznymi. Nie bez znaczenia są też modele anatomiczne czaszki w medycynie sądowej i antropologii. Modele anatomiczne czaszki, które różnią się stopniem szczegółowości i surowcem wytworzenia. Jednym spośród najbardziej istotnych typów są standardowe modele anatomiczne czaszki ludzkiej, przedstawiające główne kości także ich związania. Modele anatomiczne tego rodzaju są często wykorzystywane w edukacji również służą do nauki podstawowej anatomii czaszki. Inną kategorię stanowią modele anatomiczne czaszki z ruchomymi elementami, które gwarantują na łatwiejsze poznanie połączeń pomiędzy kośćmi oraz procesów ich ruchu, co jest wyjątkowo pomocne w ortodoncji i chirurgii szczękowej. W wyjątkowo rozwinięte modele anatomiczne czaszki mogą być rozkładane na pojedyncze kości, co umożliwia na określone badanie niektórych elementów.

Dzięki temuż wolno zobaczyć, w jaki sposób poszczególne kości są ze sobą połączone, jakie mają kształty i jakie grupy anatomiczne się na nich znajdują. Tego rodzaju modele anatomiczne są niezwykle przydatne w szkole anatomii i chirurgii, ponieważ pozwalają szczegółową analizę struktur niemożliwych do zaobserwowania w rzeczywistej czaszce. Innym rodzajem są modele anatomiczne czaszki z zaznaczonymi strukturami anatomicznymi, które pomagają w nauce szczegółowej anatomii. W takich modelach inne czynniki czaszki są oznaczone kolorami, co umożliwia ich identyfikację. Na przykład kości tworzące podstawę czaszki mogą być oznaczone różnym kolorem niż kości sklepienia, a kanały nerwowe i otwory mogą być wyróżnione w sposób sprzyjający ich zapamiętanie. Jest to szczególnie odpowiednie dla studentów medycyny, którzy muszą opanować skomplikowaną terminologię anatomiczną. Dla bardziej zaawansowanych użytkowników dostępne są modele anatomiczne czaszki z odwzorowanymi strukturami nerwowymi i naczyniowymi. Tego rodzaju modele anatomiczne mają przebieg nerwów czaszkowych oraz naczyń krwionośnych, co jest niezmiernie kluczowe w nauce neuroanatomii i neurochirurgii. Dzięki nim wolno prześledzić ścieżki rozwoju nerwów, ich ulokowanie względem struktur kostnych oraz miejsca, w jakich mogą być one uciskane lub uszkadzane. Nowa technika daje również na kształtowanie modeli czaszki w technice druku 3D. Modele anatomiczne te mogą być tworzone na bazie konkretnych danych tomograficznych, co umożliwia na odwzorowanie charakterystycznych cech anatomicznych pacjenta. Takie modele anatomiczne są wyjątkowo przydatne w planowaniu operacji chirurgicznych, ponieważ pozwalają lekarzom wcześniejsze przećwiczenie technologii na dokładnym odwzorowaniu czaszki pacjenta. Technologia ta jest także używana w rekonstrukcji twarzy w przypadkach urazów oraz deformacji wrodzonych.